| Class | Name | Species | Source | |
|---|---|---|---|---|
| miRNA | novel_jre_miR541 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR542 | Juglans regia | SRR1170960;SRR1170964;SRR1170966;SRR1170970;SRR1168883;SRR1168886 | |
| miRNA | novel_jre_miR543 | Juglans regia | SRR1170960;SRR1168880;SRR1168883;SRR1168886 | |
| miRNA | novel_jre_miR544 | Juglans regia | SRR1170960;SRR1170964 | |
| miRNA | novel_jre_miR545 | Juglans regia | SRR1170960;SRR1168883 | |
| miRNA | novel_jre_miR546 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR547 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR548 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR549 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR550 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR551 | Juglans regia | SRR1168796 | |
| miRNA | novel_jre_miR552 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR553 | Juglans regia | SRR1170960 | |
| miRNA | novel_jre_miR554 | Juglans regia | SRR1170960;SRR1168880;SRR1170963;SRR1168886 | |
| miRNA | novel_jre_miR555 | Juglans regia | SRR1170960 | |
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