ncRNA ID | novel_ath_miR696 |
Species | Arabidopsis thaliana |
Class | miRNA |
Genome position | Chr4:2178980-2179146 [+] |
Reference genome | TAIR10 |
Source | ERR1337967;ERR1337968 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AAGUGUUUGACGUGCUCGAUC - 21 |
Stem-loop(if miRNA) |
--     U  G  G    C   C  C      A       AUC           U   UUCAAA   A A    UU   GA  UU   AAGUG UU AC UGCU GAU UG UCUUCU UGUCUUC   GUCAUCACAAA UUC      CUU A UAUC  AAG  CC  C   ||||| || || |||| ||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||      ||| | ||||  |||  ||   UUCAC AA UG AUGA CUA AC AGGAGA AUAGAAG   CAGUAGUGUUU AAG      GAG U AUAG  UUC  GG  A CU     C  A  G    A   A  U      C       CAA           C   CAAUUA   A A    --   -A  CA |
Stem-loop sequence | AAGUGUUUGACGUGCUCGAUCUGCUCUUCUAUGUCUUCAUCGUCAUCACAAAUUUCUUCAAACUUAAAUAUCUUAAGGACCUUCAACGGACUUGAUAAUAGAGAUUAACGAACUUUGUGAUGACAACGAAGAUACAGAGGAUCAAAUCAAGUAGGUAAACCACUUUC |