Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_ath_miR696
Species Arabidopsis thaliana
Class miRNA
Genome position Chr4:2178980-2179146 [+]
Reference genome TAIR10
Source ERR1337967;ERR1337968
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - AAGUGUUUGACGUGCUCGAUC - 21
Stem-loop(if miRNA) --     U  G  G    C   C  C      A       AUC           U   UUCAAA   A A    UU   GA  UU
  AAGUG UU AC UGCU GAU UG UCUUCU UGUCUUC   GUCAUCACAAA UUC      CUU A UAUC  AAG  CC  C
  ||||| || || |||| ||| || |||||| |||||||   ||||||||||| |||      ||| | ||||  |||  ||
  UUCAC AA UG AUGA CUA AC AGGAGA AUAGAAG   CAGUAGUGUUU AAG      GAG U AUAG  UUC  GG  A
CU     C  A  G    A   A  U      C       CAA           C   CAAUUA   A A    --   -A  CA
Stem-loop sequence AAGUGUUUGACGUGCUCGAUCUGCUCUUCUAUGUCUUCAUCGUCAUCACAAAUUUCUUCAAACUUAAAUAUCUUAAGGACCUUCAACGGACUUGAUAAUAGAGAUUAACGAACUUUGUGAUGACAACGAAGAUACAGAGGAUCAAAUCAAGUAGGUAAACCACUUUC