ncRNA ID | novel_ath_miR623 |
Species | Arabidopsis thaliana |
Class | miRNA |
Genome position | Chr3:16356035-16356159 [-] |
Reference genome | TAIR10 |
Source | SRR3707791 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 102 - CUUAGGAUUUAGGGUUUAGGCUUU - 125 |
Stem-loop(if miRNA) |
-C     AU     G       UU           -G       U   UG      GU       UUAGG  UUAGG UUUAGGC  UAAAGUCAAGG  CUAGGGU UAA  UCUAGG  UUAGG   |||||  ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||| |||  ||||||  ||||A   GAUUU  GAUUU GGAUUUG  AUUUCGGUUUU  GAUUUUA AUU  GGAUCU  GAUUU UU     GC     A       UU           AG       C   UG      AU     |
Stem-loop sequence | CUUAGGAUUUAGGGUUUAGGCUUUAAAGUCAAGGGCUAGGGUUUAAUGUCUAGGGUUUAGGAUUUAGUAUCUAGGGUUUACAUUUUAGGAUUUUGGCUUUAUUGUUUAGGAUUUAGCGUUUAGUU |