Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_ath_miR623
Species Arabidopsis thaliana
Class miRNA
Genome position Chr3:16356035-16356159 [-]
Reference genome TAIR10
Source SRR3707791
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 102 - CUUAGGAUUUAGGGUUUAGGCUUU - 125
Stem-loop(if miRNA) -C     AU     G       UU           -G       U   UG      GU    
  UUAGG  UUAGG UUUAGGC  UAAAGUCAAGG  CUAGGGU UAA  UCUAGG  UUAGG
  |||||  ||||| |||||||  |||||||||||  ||||||| |||  ||||||  ||||A
  GAUUU  GAUUU GGAUUUG  AUUUCGGUUUU  GAUUUUA AUU  GGAUCU  GAUUU
UU     GC     A       UU           AG       C   UG      AU    
Stem-loop sequence CUUAGGAUUUAGGGUUUAGGCUUUAAAGUCAAGGGCUAGGGUUUAAUGUCUAGGGUUUAGGAUUUAGUAUCUAGGGUUUACAUUUUAGGAUUUUGGCUUUAUUGUUUAGGAUUUAGCGUUUAGUU