ncRNA ID | novel_ath_miR140 |
Species | Arabidopsis thaliana |
Class | miRNA |
Genome position | Chr1:15098055-15098199 [-] |
Reference genome | TAIR10 |
Source | SRR1822372 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - UUUGGAUUUUAGGUUUUGGGAUUU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--         UU         UGA      G     G   AA  G      -G     -AGUUU  G  UUA   GUUUUAAAG  UGGGAUCUA   UUUAGA UUUAG UUU  AG UUUAGG  UUAAG      AU GU   G   |||||||||  |||||||||   |||||| ||||| |||  || ||||||  |||||      || ||   G   UAGGGUUUU  AUUUUAGGU   GGAUUU GGAUU GGG  UU GGAUUU  GAUUU      UG CA   G UU         GG         UUG      G     G   AA  G      AG     GGGCUU  G  UUU |
Stem-loop sequence | GUUUUAAAGUUUGGGAUCUAUGAUUUAGAGUUUAGGUUUAAAGGUUUAGGGUUAAGAGUUUAUGGUUUAGGGUUUACGGUUUCGGGUUUAGGAUUUAGGGUUAAGGGGUUAGGGUUUAGGGUUUGGAUUUUAGGUUUUGGGAUUU |