Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_ath_miR140
Species Arabidopsis thaliana
Class miRNA
Genome position Chr1:15098055-15098199 [-]
Reference genome TAIR10
Source SRR1822372
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUUGGAUUUUAGGUUUUGGGAUUU - 24
Stem-loop(if miRNA) --         UU         UGA      G     G   AA  G      -G     -AGUUU  G  UUA
  GUUUUAAAG  UGGGAUCUA   UUUAGA UUUAG UUU  AG UUUAGG  UUAAG      AU GU   G
  |||||||||  |||||||||   |||||| ||||| |||  || ||||||  |||||      || ||   G
  UAGGGUUUU  AUUUUAGGU   GGAUUU GGAUU GGG  UU GGAUUU  GAUUU      UG CA   G
UU         GG         UUG      G     G   AA  G      AG     GGGCUU  G  UUU
Stem-loop sequence GUUUUAAAGUUUGGGAUCUAUGAUUUAGAGUUUAGGUUUAAAGGUUUAGGGUUAAGAGUUUAUGGUUUAGGGUUUACGGUUUCGGGUUUAGGAUUUAGGGUUAAGGGGUUAGGGUUUAGGGUUUGGAUUUUAGGUUUUGGGAUUU