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BaseInfo

ncRNA ID CNT0041747
Species Arabidopsis thaliana
Class lncRNA
Genome position 2:5249235-5252051[+]
Reference genome NA
Source CANTATAdb
CPC status noncoding
CPC score -1.25914
Max peptide length 86
Max expression 0
Potential function splicing regulation, masking miRNA binding sites
lncRNA sequence ATCAACTCTCTAATAAGCTCACTGCTTATCATTGGTGCTTTCTGATATAACCTTATTTTTACTGTTTTTAACTATGTTTTATATATATAGGTTTTTGAGTCTTTTTGTTATGTTTAGATTCTTTTTAGAGTCTTTTCATGTATTCTATGGAGTGAGACAACAATGGAGATGAGAAGACATTTTGGAACAAAAGCTGAGAAAAAGAAGCTAAAGGACGAATTCTCTTTCAGATCCTCTCGAGAGTATTGATCGACACACTCTTGATGTCGATAGACACCAGTTGCGGCCCAGAGAAGTCCATGCACGATTTTTAGGTCTTATATATAGTTTTAAATCCCCATTCACCCAAATGACCAAGAAAAAACTACTTTTTGTTGTCTTTATGGAACCTTTGCTTACAGGCGTATGCCTTTCGGGCTCTGTAATGCACCCTGCTACCTTTCAACGGTGTATGACTTCCATTTTCTCGAATTTGATAGAGGAGATGGTAGATGATATGGTTCAAATTACCTAGAACTACTCTCTCCAATAAGAGATCAATTGCAGTATTTTAGGATCGAATTCACGGAGTTCTTTTGTTCAAACAGTGAGTTAAATGTCGAGATTAAGCTAGCAGGGTATGACACCAAGAGTGTGTCGATCGACACTCCTCGCTGATTCCTGAATCCAAAATCATCCTTAGCTTCCTTTTCCTTAGCTCTTGCTCCAAAATGTCTCCTTATCTCCATTGTTGTCCCATTGCATAGAGTACCTGAAAAGACACTAAAAAGACTCGAGAAATAACATAAAGACTCAAAATCCTCTACCTAAAACATAGATAAAATCAATGAAATTCGGGTTATATCTGATAAGTGTGTATTTTGCATATTTTGAGCATCCATTTGTCATCACTTTAGCATCATATCATCACTGTTTTATACCATTTCTCATCATTCGTCATCACTTTGCGTGTTTCGGATAGATTTGCATACATATTGCATATTTGTGTTGATTTCAGGTGATTTGGAGCTGTTGACGAGCTAATTGGAAGAAGCGGACCTGATCATGTCAAACCACTCGACCCCCAGGTCGAGTAGACACTTCACGACCTCAACAGAACACTCGATCCCCTGTTCGAGTAGTGTCCTTCACCATTTCACCTCATTACTCGACTCCCTGGCCGAGTACCACCACGAGAAACACTCGATCACATCACTTGACCCCGAGGCCGAGTGTCTTCACCTCCACAACCTGACCATCACTCGATCACATCACTCGACCCCGAGGTCTAGTGTCTTCACCTCCACTAACTGATCATCACTCGATCACACCATCTACCTGGAAGTCGAGTATTCACCATCACCACCACTCGACTACATACTCGATGGCGAGCTTCAGAGTCTTCTCCATTCCGCACTCAACCAGACACTCGAGCACAAGGAAGAAAAAAAGACTCCAGCTTATCACTCGACCTCTCACTCGACCATCTGGGTCGAGTACTGTTCTTAATCCGTCCCAATACTGCGTCGTTTTAAGTATTAGGGTTTCGGAAAATTTTGCTATAAGTAGCATGTACTTTACATTTTCGAGAACAAGTTTTTATCTAGTTTTATTCCGCAGACATTGTGTTCTAGACCTTTTGTAATCCGGATTTCTCTTTATATATTCAGTATTCAGTATTTGTTCTTGATTTCATTTACTGTTATTCATCCTGTTATCATTTTGCTATTACATTGTTGTAATCATGTTTTCATCATGTTCAACGTTTATGTTCTCTACAATGATGTCTAAGTAGTGAATAGGTTTATGAGGATGGGTTAGAGTAGTGTAGAATTCTCAGTATGCTAGGTGGTTGAGTATTGATTGATAGATCCCTTCTGGATTAGTTGTTCTTAATGCCTATTGCTTTCTGATCAACTGGAATTTGAGCCCAGACATTTCCGCGCCCAAAAGGTGTTCGATGAAATGTCTGAACTACTAATTCCAGAGATTCGTGGCCCTGTACCAAGGTATTGGTTGCAGTGAGCGTTTTGGCTTTAACTTGTTGATTCGTAATGCCTGTTAGGTTAGCTCTCGTCAATGGTGATTGAGTCTGGGACTAGGTTAACTTGAGGGTCTCTGTTGCGGTGGCACTTAGATTTGGTTAATGAACTTGTTGTCTGGGGATAATTTATTGAGCATGTCAATCACCTGTAAACTGAGGAAACGAAACTACTCAATTACCCCATCCTCGGGAATTCTTTATCTGATTGATTTTATTGTTTACTCTACTGTTGTTTACTCCATCTTGTTACCTGTTGTTTAGTTTTTGCACTTCTCTCCTGTTACTCGACCTGATACTCGACCACCTAGTTGTCTGGCAATAGACTGTGCAGTCGAGTGTCTCTATTTTGTTTACTGCCTTTTACTCGACCAAGTCACTCGACCACATCCAGTGCTCTACAACGAGCTGTGTTGGTCGAGTGTTTTACTGTTTCTGTTTGATTTTCTGTTTTCTGCATGTTCACTTAGGACTGCTAGAACACACCAAAACCTGTTATTTCTTGGCTTGACTTAGTGTCTTCTGATCACATCTTGATTGTTAGCATTACACCCATTTGGATTGACAACCTTCAGTACTACAACGACATGATAGTGCTTTAGGAGTAATTGATCTTAAAAACCTATTATCAATATCAGTAGAGGTGTTCATGGATGATTTTTCCATGTATGGCTCTTCCGTCTCCTCCTGTTTGTTGAACTTGTGCAGGATACTCAAAAGATGTGAGGTGTTTGTTTGTTACATTTGAGATTTCAGACTTGCTTAGATCAAGTTCTTTTTCAATTTTCAATTCGGTT