Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR13242
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr10:16732611-16732785 [+]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5451005
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 152 - AUUCUGAUGGCAUUGAAGGGAUUG - 175
Stem-loop(if miRNA) -----A    U    G    UAA     CA   --UAGA        G   UG  --      GACU  AAA     --   AC G      CU
      UUUC AGUG CAUU   GGGAU  AUA      UUUUAAUG CAU  GA  GAGAUU    UU   UUGAA  CUA  G CGUUAG  C
      |||| |||| ||||   |||||  |||      |||||||| |||  ||  ||||||    ||   |||||  |||  | ||||||  U
      GAAG UUAC GUAG   UCUUA  UAU      GAAGUUAC GUA  UU  UUUUAA    AG   AACUU  GGU  U GCAAUC  A
GUUAGG    -    G    ---     AA   UGAAGG        G   GU  AA      AAUU  -GG     AC   AA G      AA
Stem-loop sequence AUUUCUAGUGGCAUUUAAGGGAUCAAUAUAGAUUUUAAUGGCAUUGGAGAGAUUGACUUUAAAUUGAACUAACGGCGUUAGCUCUAAACUAACGGUAAUGGCAUUCAAGGGAUUAAAAUUUUAAUUUGAUGGCAUUGAAGGGAAGUUAUAAAUUCUGAUGGCAUUGAAGGGAUUG