Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR13072
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr6:159475238-159475375 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5451004
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AUAGGAUCGAUUGUAGAGAUAGGA - 24
Stem-loop(if miRNA) --    GGA  UG          GAG        U       GGA   U       G  GAG      U
  UUAU   UA  GUCGGUUUUA   AUAGGAUA GUUUUGU   UAU GUCGGUU UA   AUAGAA C
  ||||   ||  ||||||||||   |||||||| |||||||   ||| ||||||| ||   ||||||
  GAUA   AU  UAGCUAGGAU   UGUUUUAU UAAGAUA   AUG UAGCUAG AU   UGUUUU U
AG    GAG  GU          AAA        C       GAG   U       G  AAG      A
Stem-loop sequence UUAUGGAUAUGGUCGGUUUUAGAGAUAGGAUAUGUUUUGUGGAUAUUGUCGGUUGUAGAGAUAGAAUCUAUUUUGUGAAUAGGAUCGAUUGUAGAGAUAGAAUCUAUUUUGUAAAUAGGAUCGAUUGUAGAGAUAGGA