Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR12937
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr2:82101403-82101516 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5451004
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 93 - CCGCGGGAAGAAGACUGAGUAU - 114
Stem-loop(if miRNA) --   --     A A   CU    A   UGA   CCC      ----A   AGUA     G A
  CCG  CGGGA G AGA  GAGU UCU   AAU   UCUCAA     GAC    UCAAG G U
  |||  ||||| | |||  |||| |||   |||   ||||||     |||    ||||| |
  GGC  GCUCU C UCU  CUCA AGG   UUA   AGAGUU     UUG    GGUUC C G
AG   UG     C C   --    A   -UA   ---      GUUAC   GUGA     G G
Stem-loop sequence CCGCGGGAAGAAGACUGAGUAUCUUGAAAUCCCUCUCAAAGACAGUAUCAAGGGAUGGCGCUUGGAGUGGUUCAUUGUUGAGAAUUAUGGAAACUCUCUCCCUCUCGGUCGGGA