Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR12718
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr6:159475237-159475376 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5451003
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - UAGGAUCGAUUGUAGAGAUAGGAU - 24
Stem-loop(if miRNA) --     GGA  UG          GAG        U       GGA   U       G  GAG      U
  UUUAU   UA  GUCGGUUUUA   AUAGGAUA GUUUUGU   UAU GUCGGUU UA   AUAGAA C
  |||||   ||  ||||||||||   |||||||| |||||||   ||| ||||||| ||   ||||||
  GGAUA   AU  UAGCUAGGAU   UGUUUUAU UAAGAUA   AUG UAGCUAG AU   UGUUUU U
UA     GAG  GU          AAA        C       GAG   U       G  AAG      A
Stem-loop sequence UUUAUGGAUAUGGUCGGUUUUAGAGAUAGGAUAUGUUUUGUGGAUAUUGUCGGUUGUAGAGAUAGAAUCUAUUUUGUGAAUAGGAUCGAUUGUAGAGAUAGAAUCUAUUUUGUAAAUAGGAUCGAUUGUAGAGAUAGGAU