Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR12651
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr4:71196894-71197013 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5451003;SRR1997866
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 97 - AGGAGAUAGGUAGAAUAGAUAGUG - 120
Stem-loop(if miRNA) --   A   A -    A  -    A U   CACAAC    AA    AUA       AGUC    A
  AGG GAU G GUAG AU AGAU G GAU      UUGU  AGGG   ACCCUCU    ACCU U
  ||| ||| | |||| || |||| | |||      ||||  ||||   |||||||    |||| A
  UCC CUA C CAUC UA UCUA C CUA      AGCA  UCCC   UGGGAGA    UGGA U
AC   -   C A    C  C    - U   --CAAA    --    -CA       --GC    A
Stem-loop sequence AGGAGAUAGGUAGAAUAGAUAGUGAUCACAACUUGUAAAGGGAUAACCCUCUAGUCACCUAUAUAAGGUCGAGAGGGUACCCCUACGAAAACAUCUCAUCUCAUCCUACACCAUCCCUCA