Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR11879
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr7:134663779-134663866 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5100255
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 1 - GCUCUCUGCUCUCACUGUCAUC - 22
Stem-loop(if miRNA) --      -A    -          --A   -A   CC       A
  UGACAG  AGAG AGAGAGCACA   CCC  GCA  AGCGAGG A
  ||||||  |||| ||||||||||   |||  |||  ||||||| A
  ACUGUC  UCUC UCUCUCGUGU   GGG  CGU  UCGCUCC A
CU      AC    G          GCC   AG   CU       G
Stem-loop sequence UGACAGAAGAGAGAGAGCACAACCCAGCACCAGCGAGGAAAAGCCUCGCUUCUGCGAGGGCCGUGUGCUCUCUGCUCUCACUGUCAUC