ncRNA ID | novel_zma_miR11293 |
Species | Zea mays |
Class | miRNA |
Genome position | Chr9:61718697-61718823 [-] |
Reference genome | RefGen_v4 |
Source | SRR5100248 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 107 - UUCCGGAUUGUGUCUGACACC - 127 |
Stem-loop(if miRNA) |
--     GA      CU  C  --CCA -   A   GA  CCA  A  A  AAGG  -GA  -   AA   UUCCG  UUGUGU  GA AC     G GGU GGG  CC   GC GC GC    GC   UG GGU  U   |||||  ||||||  || ||     | ||| |||  ||   || || ||    ||   || |||   AAGGC  GACACG  CU UG     C CCA CCC  GG   CG CG CG    CG   AC CCA  C AU     --      AC  U  ACCAA G   A   AC  --A  A  A  ACGA  ACG  U   GC |
Stem-loop sequence | UUCCGGAUUGUGUCUGACACCCAGGGUAGGGGACCCCAGCAGCAGCAAGGGCGAUGGGUAAUCCGACCUCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCACCCAACCGCAACCAGUUUCCAGCACAGCGGAAUA |