Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR11293
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr9:61718697-61718823 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5100248
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 107 - UUCCGGAUUGUGUCUGACACC - 127
Stem-loop(if miRNA) --     GA      CU  C  --CCA -   A   GA  CCA  A  A  AAGG  -GA  -   AA
  UUCCG  UUGUGU  GA AC     G GGU GGG  CC   GC GC GC    GC   UG GGU  U
  |||||  ||||||  || ||     | ||| |||  ||   || || ||    ||   || |||
  AAGGC  GACACG  CU UG     C CCA CCC  GG   CG CG CG    CG   AC CCA  C
AU     --      AC  U  ACCAA G   A   AC  --A  A  A  ACGA  ACG  U   GC
Stem-loop sequence UUCCGGAUUGUGUCUGACACCCAGGGUAGGGGACCCCAGCAGCAGCAAGGGCGAUGGGUAAUCCGACCUCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGCACCCAACCGCAACCAGUUUCCAGCACAGCGGAAUA