Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR10852
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr4:50798932-50799085 [+]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5100248
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 134 - CUGGAGUAGAACAUGGAAACU - 154
Stem-loop(if miRNA) --        C        GA  CU  A  G A   C    G       CCAC      ----    A     -A    A
  UUUCCAUG UCUACUCU  UC  AG CA A UUU GGUA CACCUCC    UGUUCU    ACGG UACAC  UCCU G
  |||||||| ||||||||  ||  || || | ||| |||| |||||||    ||||||    |||| |||||  ||||
  AAAGGUAC AGAUGAGG  AG  UC GU U AAA CCGU GUGGAGG    ACAAGA    UGUC AUGUG  AGGG C
UC        A        UC  AC  C  G C   A    A       UACA      GGUA    -     AG    A
Stem-loop sequence UUUCCAUGCUCUACUCUGAUCCUAGACAGAAUUUCGGUAGCACCUCCCCACUGUUCUACGGAUACACAUCCUAGCAGGGAGAGUGUACUGUAUGGAGAACAACAUGGAGGUGAUGCCAAAACUGUGCCUCAGACUGGAGUAGAACAUGGAAACU