ncRNA ID | novel_zma_miR10386 |
Species | Zea mays |
Class | miRNA |
Genome position | Chr6:25414601-25414788 [-] |
Reference genome | RefGen_v4 |
Source | SRR1997865;SRR1997866 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - CCAUCGGAUCUAGAUCGGGCGGCU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--           -U   G  C   CUA       ---AC   --CG     C   G   U      ----    G    AGAUUA   AUGGUGUAACAU   CCGUCUGAUCU  AUC GA GGU   GAUUUGA     CAG    UCAGC GUU AUC CUGGAU    GAUC ACAG      GGU            U   |||||||||||  ||| || |||   |||||||     |||    ||||| ||| ||| ||||||    |||| ||||      |||            U   GGCGGGCUAGA  UAG CU CCA   CUAAAUU     GUU    AGUUG CAA UAG GACCUA    UUAG UGUC      CUU            C UC           UC   G  A   UUC       ACUCA   CCUA     -   G   U      GUGU    A    ----GA   UAGCAGGGCCAG |
Stem-loop sequence | CCGUCUGAUCUUAUCGGACGGUCUAGAUUUGAACCAGCGUCAGCCGUUGAUCUCUGGAUGAUCGACAGAGAUUAGGUAUGGUGUAACAUUUCGACCGGGACGAUUUCAGCUGUAGAUUUGUGAUCCAGUGAUGAACGUUGAAUCCUUGACUCAUUAAAUCCUUACCAUCGGAUCUAGAUCGGGCGGCU |