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BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR10386
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr6:25414601-25414788 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR1997865;SRR1997866
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - CCAUCGGAUCUAGAUCGGGCGGCU - 24
Stem-loop(if miRNA) --           -U   G  C   CUA       ---AC   --CG     C   G   U      ----    G    AGAUUA   AUGGUGUAACAU
  CCGUCUGAUCU  AUC GA GGU   GAUUUGA     CAG    UCAGC GUU AUC CUGGAU    GAUC ACAG      GGU            U
  |||||||||||  ||| || |||   |||||||     |||    ||||| ||| ||| ||||||    |||| ||||      |||            U
  GGCGGGCUAGA  UAG CU CCA   CUAAAUU     GUU    AGUUG CAA UAG GACCUA    UUAG UGUC      CUU            C
UC           UC   G  A   UUC       ACUCA   CCUA     -   G   U      GUGU    A    ----GA   UAGCAGGGCCAG
Stem-loop sequence CCGUCUGAUCUUAUCGGACGGUCUAGAUUUGAACCAGCGUCAGCCGUUGAUCUCUGGAUGAUCGACAGAGAUUAGGUAUGGUGUAACAUUUCGACCGGGACGAUUUCAGCUGUAGAUUUGUGAUCCAGUGAUGAACGUUGAAUCCUUGACUCAUUAAAUCCUUACCAUCGGAUCUAGAUCGGGCGGCU