Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR10070
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr5:148500862-148500966 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5099742;SRR5105959
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 85 - AAGUUGUCACCCACUAUGUGU - 105
Stem-loop(if miRNA) --       C  C       U   G   C    UCG    --GC    A    C
  AAGUUGU AC CACUAUG GUA AAA CUAG   GUCU    AAUG AGUU U
  ||||||| || ||||||| ||| ||| ||||   ||||    |||| ||||
  UUCAACA UG GUGAUAC CAU UUU GAUU   CAGG    UUAU UUAG A
CU       A  C       C   A   A    -CA    AAGU    A    U
Stem-loop sequence AAGUUGUCACCCACUAUGUGUAGAAACCUAGUCGGUCUGCAAUGAAGUUCUAUGAUUAUAUUUGAAGGACACUUAGAUUUAUACCCAUAGUGCGUAACAACUUUC