ncRNA ID | novel_zma_miR9984 |
Species | Zea mays |
Class | miRNA |
Genome position | Chr10:134104225-134104361 [+] |
Reference genome | RefGen_v4 |
Source | SRR5099742 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 114 - AGCGCUGUACUGUCUACUGAACAG - 137 |
Stem-loop(if miRNA) |
--U            AUU        -AU   --   AUGU       AUAUUU   UAUUUU  UA    UA    UUUAGUAGAUAG   UGGCGCUG   GUU  UCC    GCUUAGG      CCC      AG  UCGG  C    ||||||||||||   ||||||||   |||  |||    |||||||      |||      ||  ||||  A    AAGUCAUCUGUC   GUCGCGAC   CGA  AGG    UGAGUCU      GGG      UC  AGUC  A GAC            -AU        GAU   AC   ----       ACUCAU   --UCAU  UA    UU |
Stem-loop sequence | UUUUAGUAGAUAGAUUUGGCGCUGAUGUUUCCAUGUGCUUAGGAUAUUUCCCUAUUUUAGUAUCGGUACAAUUCUGAAUCUUACUGGGUACUCAUCUGAGUGGACAAGCUAGCAGCGCUGUACUGUCUACUGAACAG |