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BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR9984
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr10:134104225-134104361 [+]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR5099742
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 114 - AGCGCUGUACUGUCUACUGAACAG - 137
Stem-loop(if miRNA) --U            AUU        -AU   --   AUGU       AUAUUU   UAUUUU  UA    UA
   UUUAGUAGAUAG   UGGCGCUG   GUU  UCC    GCUUAGG      CCC      AG  UCGG  C
   ||||||||||||   ||||||||   |||  |||    |||||||      |||      ||  ||||  A
   AAGUCAUCUGUC   GUCGCGAC   CGA  AGG    UGAGUCU      GGG      UC  AGUC  A
GAC            -AU        GAU   AC   ----       ACUCAU   --UCAU  UA    UU
Stem-loop sequence UUUUAGUAGAUAGAUUUGGCGCUGAUGUUUCCAUGUGCUUAGGAUAUUUCCCUAUUUUAGUAUCGGUACAAUUCUGAAUCUUACUGGGUACUCAUCUGAGUGGACAAGCUAGCAGCGCUGUACUGUCUACUGAACAG