ncRNA ID | novel_zma_miR8340 |
Species | Zea mays |
Class | miRNA |
Genome position | Chr1:172454781-172454956 [+] |
Reference genome | RefGen_v4 |
Source | SRR3385660 |
Length | 18 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AUCCGAUCUCACCAGCAG - 18 |
Stem-loop(if miRNA) |
--   C             -GU    G   GA       GCUGA G   A    AUCCA       AGAA        UC   -AU    U   AUC GAUCUCACCAGCA   UUCA UAG  UAGGUUA     U CUC AGGA     GGUGAGU    AUAUCAAU  CGG   UACC U   ||| |||||||||||||   |||| |||  |||||||     | ||| ||||     |||||||    ||||||||  |||   |||| U   UAG CUAGAGUGGUUGU   GAGU AUC  AUCUAGU     A GAG UCUU     UUACUCG    UGUAGUUG  GUU   GUGG G UA   A             AAC    -   AA       ----A G   G    AAUAG       GCCG        GA   GGU    U |
Stem-loop sequence | AUCCGAUCUCACCAGCAGUUUCAGUAGGAUAGGUUAGCUGAUGCUCAAGGAAUCCAGGUGAGUAGAAAUAUCAAUUCCGGAUUACCUUUGUGGUGUGGUUGAGGUUGAUGUGCCGGCUCAUUGAUAAUUCUGGAGGAAUGAUCUAAACUAUGAGCAAUGUUGGUGAGAUCAGAUAU |