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BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR8340
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr1:172454781-172454956 [+]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR3385660
Length 18
Mature sequence(if miRNA) 1 - AUCCGAUCUCACCAGCAG - 18
Stem-loop(if miRNA) --   C             -GU    G   GA       GCUGA G   A    AUCCA       AGAA        UC   -AU    U
  AUC GAUCUCACCAGCA   UUCA UAG  UAGGUUA     U CUC AGGA     GGUGAGU    AUAUCAAU  CGG   UACC U
  ||| |||||||||||||   |||| |||  |||||||     | ||| ||||     |||||||    ||||||||  |||   |||| U
  UAG CUAGAGUGGUUGU   GAGU AUC  AUCUAGU     A GAG UCUU     UUACUCG    UGUAGUUG  GUU   GUGG G
UA   A             AAC    -   AA       ----A G   G    AAUAG       GCCG        GA   GGU    U
Stem-loop sequence AUCCGAUCUCACCAGCAGUUUCAGUAGGAUAGGUUAGCUGAUGCUCAAGGAAUCCAGGUGAGUAGAAAUAUCAAUUCCGGAUUACCUUUGUGGUGUGGUUGAGGUUGAUGUGCCGGCUCAUUGAUAAUUCUGGAGGAAUGAUCUAAACUAUGAGCAAUGUUGGUGAGAUCAGAUAU