Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR8312
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr9:159677170-159677261 [+]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR3385651
Length 20
Mature sequence(if miRNA) 73 - GUGUUGAACAUGCAUGCCUA - 92
Stem-loop(if miRNA) --   U     -    U   ----    A  GA   - -AA  AUA   U
  GGC UGCAU UUCA CAC    GCUC AG  UCU C   UC   UAG A
  ||| ||||| |||| |||    |||| ||  ||| |   ||   ||| C
  CCG ACGUA AAGU GUG    CGAG UC  AGA G   AG   GUC C
AU   U     C    U   UGUC    C  AG   A GAG  --G   G
Stem-loop sequence GGCUUGCAUUUCAUCACGCUCAAGGAUCUCAAUCAUAUAGUACCGCUGGGAGAGGAAGAGACUCGAGCCUGUGUGUUGAACAUGCAUGCCUA