ncRNA ID | novel_zma_miR5468 |
Species | Zea mays |
Class | miRNA |
Genome position | Chr5:75358194-75358387 [+] |
Reference genome | RefGen_v4 |
Source | SRR2638137;SRR2647386;SRR2647388;SRR2647390 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AGUUAUGAUCUAUGAUAUGGACAU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
---AG    G      GA  UG       GUG     GC   G       --A  UUUG   UGU   A   C    -UACC    UU  -   U      UU      UUAU AUCUAU  UA  GACAUGU   GAUAU  CAU UGCUUAA   UA    CAU   UGC UGG AACA     UACA  GC AUA UUAAUA  U      |||| ||||||  ||  |||||||   |||||  ||| |||||||   ||    |||   ||| ||| ||||     ||||  || ||| ||||||      AGUA UAGGUA  GU  UUGUACA   UUGUA  GUA ACGAGUU   AU    GUA   ACG AUC UUGU     GUGU  UG UAU GGUUAU  G CGUUA    G      AA  GU       ---     AA   -       GUG  UUUA   --U   -   U    UUAAA    UU  G   U      UA |
Stem-loop sequence | AGUUAUGAUCUAUGAUAUGGACAUGUGUGGAUAUGCCAUGUGCUUAAAUAUUUGCAUUGUUGCAUGGCAACAUACCUACAUUGCAUAUUUAAUAUUUGAUUAUUGGUUAUGGUUUUGUGAAAUUUGUUUCUAGCAUAUGAUUUUAGUGUUGAGCAAUGAAAUGUUACAUGUUUGUGAAAUGGAUGAUGAAUUGC |