Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR5468
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr5:75358194-75358387 [+]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR2638137;SRR2647386;SRR2647388;SRR2647390
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGUUAUGAUCUAUGAUAUGGACAU - 24
Stem-loop(if miRNA) ---AG    G      GA  UG       GUG     GC   G       --A  UUUG   UGU   A   C    -UACC    UU  -   U      UU
     UUAU AUCUAU  UA  GACAUGU   GAUAU  CAU UGCUUAA   UA    CAU   UGC UGG AACA     UACA  GC AUA UUAAUA  U
     |||| ||||||  ||  |||||||   |||||  ||| |||||||   ||    |||   ||| ||| ||||     ||||  || ||| ||||||
     AGUA UAGGUA  GU  UUGUACA   UUGUA  GUA ACGAGUU   AU    GUA   ACG AUC UUGU     GUGU  UG UAU GGUUAU  G
CGUUA    G      AA  GU       ---     AA   -       GUG  UUUA   --U   -   U    UUAAA    UU  G   U      UA
Stem-loop sequence AGUUAUGAUCUAUGAUAUGGACAUGUGUGGAUAUGCCAUGUGCUUAAAUAUUUGCAUUGUUGCAUGGCAACAUACCUACAUUGCAUAUUUAAUAUUUGAUUAUUGGUUAUGGUUUUGUGAAAUUUGUUUCUAGCAUAUGAUUUUAGUGUUGAGCAAUGAAAUGUUACAUGUUUGUGAAAUGGAUGAUGAAUUGC