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BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR4947
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr2:142647088-142647252 [+]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR2287163
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUUGAAGUAGAUUACAUCGGAU - 22
Stem-loop(if miRNA) --       U         CGGA      U GAGA    A   -    CU   -   -    A      ACUU    GUAC   C   A
  UUUGAAG AGAUUACAU    UAUGAC G    GAUC GUU CGUC  UCU CUG UUGU UGCGCG    GCCC    CGG UGG A
  ||||||| |||||||||    |||||| |    |||| ||| ||||  ||| ||| |||| ||||||    ||||    ||| ||| U
  GGGCUUC UCUAAUGUG    GUACUG C    CUAG CAA GCAG  AGA GAC AACA AUGCGU    CGGG    GCU ACC C
CU       U         ---A      - --AA    A   U    UU   C   C    C      CAAU    ----   -   A
Stem-loop sequence UUUGAAGUAGAUUACAUCGGAUAUGACUGGAGAGAUCAGUUCGUCCUUCUCUGUUGUAUGCGCGACUUGCCCGUACCGGCUGGAAUCACCAUCGGGGCUAACUGCGUACACAACCAGCAGAUUGACGUAACAGAUCAACGUCAUGAGUGUAAUCUUCUUCGGGUC