Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR3354
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr8:81859764-81859899 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR1583944
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 113 - GAUGCUACGGAUGAUUAUAUUCGU - 136
Stem-loop(if miRNA) -GAUG   -   A  A    A     AU    -----        -G     UG  --A     AG  G   UG
     CUA CGG UG UUAU UUCGU  UGGG     GAGAGUAC  GCUAU  AA   GUUUA  AA AUU  U
     ||| ||| || |||| |||||  ||||     ||||||||  |||||  ||   |||||  || |||  A
     GAU GUC AC AGUA AAGUA  AUCC     CUUUCAUG  UGGUG  UU   CAGGU  UU UGG  A
CAUUA   C   -  -    G     --    ACUAG        AG     GU  AUG     -G  G   UG
Stem-loop sequence GAUGCUACGGAUGAUUAUAUUCGUAUUGGGGAGAGUACGGCUAUUGAAAGUUUAAGAAGAUUUGUAAGUGGUGUUGUGGACGUAUUUGGUGGUGAGUACUUUCGAUCACCUAAUGAAGAUGACACUGCUAGAUUAC