Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_zma_miR1721
Species Zea mays
Class miRNA
Genome position Chr3:180520870-180520986 [-]
Reference genome RefGen_v4
Source SRR1583944;SRR2647387
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 94 - CUAGGGGCAGUUCAACUAGUCUCU - 117
Stem-loop(if miRNA) --    -    A   C    A        -GAC     C          ---C     UC G
  CUAG GGGC GUU AACU GUCUCUGG    AUCUG UCAGUCUGUC    AGUAG  U C
  |||| |||| ||| |||| ||||||||    ||||| ||||||||||    |||||  |
  GAUC CCCG UAA UUGA CGGGGACC    UGGAC AGUCGGAUAG    UCAUC  G C
GG    A    C   C    -        AGUC     -          ACGA     CU A
Stem-loop sequence CUAGGGGCAGUUCAACUAGUCUCUGGGACAUCUGCUCAGUCUGUCCAGUAGUCUGCCAGUCCUACUAGCAGAUAGGCUGACAGGUCUGACCAGGGGCAGUUCAAUCGCCCACUAGGG