Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_osa_miR3183
Species Oryza sativa
Class miRNA
Genome position Chr1:41388229-41388299 [-]
Reference genome IRGSP-1.0
Source SRR1555747;SRR1555749;SRR1556011;SRR4407775;SRR4407779;SRR1556016;SRR1556020
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - GAUACGUGAUAGGAAUCGUCUGAU - 24
Stem-loop(if miRNA) --  C     A    A  G      CA      - U
  CA ACGAU CCUG UA GUAUCA  UGAUAC C C
  || ||||| |||| || ||||||  |||||| |
  GU UGCUA GGAU GU CAUAGU  GCUAUG G A
UA  C     A    A  G      CC      A C
Stem-loop sequence CACACGAUACCUGAUAGGUAUCACAUGAUACCUCACGAGUAUCGCCUGAUACGUGAUAGGAAUCGUCUGAU