Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_osa_miR3177
Species Oryza sativa
Class miRNA
Genome position Chr11:4981181-4981244 [-]
Reference genome IRGSP-1.0
Source SRR1555747;SRR1555749;SRR2097778;SRR2098557;SRR2098822;SRR2098823;SRR2099428;SRR2099567;SRR2099568;SRR2099745;SRR4407775;SRR4407777;SRR4407955;SRR4407956;SRR4407958;SRR1556016;SRR4407960;SRR4407962;SRR1556020;SRR1654490
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGCCGAUUGUAGAUUAGAUAGCGG - 24
Stem-loop(if miRNA) --GA       C   --        C C   AC
    UAUCUAA CUA  AUCGGCUA C UCU  A
    ||||||| |||  |||||||| | |||
    AUAGAUU GAU  UAGCCGAU G AGA  G
GGCG       A   GU        U U   CA
Stem-loop sequence GAUAUCUAACCUAAUCGGCUACCCUCUACAGACAGAUGUUAGCCGAUUGUAGAUUAGAUAGCGG