Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_osa_miR2159
Species Oryza sativa
Class miRNA
Genome position Chr3:35782430-35782522 [+]
Reference genome IRGSP-1.0
Source SRR1849769;SRR1849770;SRR1555746;SRR2097778;SRR2097779;SRR2099567;SRR2099745;SRR2099746;SRR2857728;SRR1556011;SRR3123645;SRR3123646;SRR3123651;SRR3234042;SRR1556014;SRR4407956;SRR4407962;SRR5049781;SRR1609313;SRR1738226;SRR1738228;SRR1738240
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 73 - UGGCAAGUCUCCUCGGCUACC - 93
Stem-loop(if miRNA) --     A    U        U  --     CA     AUCA      UC
  UAGCC AGGA GAUUUGCC GU  AGCCC  UUGUC    GCUCUC  C
  ||||| |||| |||||||| ||  |||||  |||||    ||||||
  AUCGG UCCU CUGAACGG CA  UCGGG  AACAG    CGAGAG  G
CC     C    -        U  UC     CC     ----      CU
Stem-loop sequence UAGCCAAGGAUGAUUUGCCUGUAGCCCCAUUGUCAUCAGCUCUCUCCGUCGAGAGCGACAACCGGGCUCUACUGGCAAGUCUCCUCGGCUACC