ncRNA ID | novel_osa_miR2159 |
Species | Oryza sativa |
Class | miRNA |
Genome position | Chr3:35782430-35782522 [+] |
Reference genome | IRGSP-1.0 |
Source | SRR1849769;SRR1849770;SRR1555746;SRR2097778;SRR2097779;SRR2099567;SRR2099745;SRR2099746;SRR2857728;SRR1556011;SRR3123645;SRR3123646;SRR3123651;SRR3234042;SRR1556014;SRR4407956;SRR4407962;SRR5049781;SRR1609313;SRR1738226;SRR1738228;SRR1738240 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 73 - UGGCAAGUCUCCUCGGCUACC - 93 |
Stem-loop(if miRNA) |
--     A    U        U  --     CA     AUCA      UC   UAGCC AGGA GAUUUGCC GU  AGCCC  UUGUC    GCUCUC  C   ||||| |||| |||||||| ||  |||||  |||||    ||||||   AUCGG UCCU CUGAACGG CA  UCGGG  AACAG    CGAGAG  G CC     C    -        U  UC     CC     ----      CU |
Stem-loop sequence | UAGCCAAGGAUGAUUUGCCUGUAGCCCCAUUGUCAUCAGCUCUCUCCGUCGAGAGCGACAACCGGGCUCUACUGGCAAGUCUCCUCGGCUACC |