Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_osa_miR1946
Species Oryza sativa
Class miRNA
Genome position Chr10:17639075-17639196 [-]
Reference genome IRGSP-1.0
Source SRR1849765;SRR1849766;SRR2040380;SRR2040381;SRR2040393;SRR2040397;SRR2040411;SRR2857730;SRR3234041
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGUGACUGCAGAGAAUCCUGAUCC - 24
Stem-loop(if miRNA) --   GA   C  A       G   U  G A           C   C  A   AC    CG
  AUU  GAU CU UGCAGUC ACU CA C UACCUUUAUCA UGA AU UGG  CCGA  C
  |||  ||| || ||||||| ||| || | ||||||||||| ||| || |||  ||||  C
  UAG  CUA GA ACGUCAG UGA GU G AUGGAAAUAGU ACU UA AUC  GGCU  A
CC   UC   A  G       -   C  G C           A   A  C   CA    AC
Stem-loop sequence AUUGAGAUCCUAUGCAGUCGACUUCAGCAUACCUUUAUCACUGACAUAUGGACCCGACGCCACAUCGGACCUACAUAUCAAUGAUAAAGGUACGGUGCAGUGACUGCAGAGAAUCCUGAUCC