ncRNA ID | novel_osa_miR1946 |
Species | Oryza sativa |
Class | miRNA |
Genome position | Chr10:17639075-17639196 [-] |
Reference genome | IRGSP-1.0 |
Source | SRR1849765;SRR1849766;SRR2040380;SRR2040381;SRR2040393;SRR2040397;SRR2040411;SRR2857730;SRR3234041 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - AGUGACUGCAGAGAAUCCUGAUCC - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--   GA   C  A       G   U  G A           C   C  A   AC    CG   AUU  GAU CU UGCAGUC ACU CA C UACCUUUAUCA UGA AU UGG  CCGA  C   |||  ||| || ||||||| ||| || | ||||||||||| ||| || |||  ||||  C   UAG  CUA GA ACGUCAG UGA GU G AUGGAAAUAGU ACU UA AUC  GGCU  A CC   UC   A  G       -   C  G C           A   A  C   CA    AC |
Stem-loop sequence | AUUGAGAUCCUAUGCAGUCGACUUCAGCAUACCUUUAUCACUGACAUAUGGACCCGACGCCACAUCGGACCUACAUAUCAAUGAUAAAGGUACGGUGCAGUGACUGCAGAGAAUCCUGAUCC |