Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_osa_miR1163
Species Oryza sativa
Class miRNA
Genome position Chr4:7253965-7254088 [+]
Reference genome IRGSP-1.0
Source SRR1742993;SRR2040408;SRR2857731
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - ACGUGAUAGGAAUCGUCUGAUACC - 24
Stem-loop(if miRNA) --     A       C  C        GA      GUAGA     A     C     A      A
  ACGUG UAGGAAU GU UGAUACCU  UACGUG     AUCAC UGAUA CUGGU GGUAUC C
  ||||| ||||||| || ||||||||  ||||||     ||||| ||||| ||||| ||||||
  UGCAC AUUCUUA CA ACUAUGGG  AUGUAC     UAGUG ACUAU GAUCG CCAUAG C
GA     C       A  U        --      ----A     G     U     A      C
Stem-loop sequence ACGUGAUAGGAAUCGUCUGAUACCUGAUACGUGGUAGAAUCACAUGAUACCUGGUAGGUAUCACCCGAUACCAGCUAGUUAUCAGGUGAUACAUGUAGGGUAUCAUACAAUUCUUACCACGUAG