ncRNA ID | novel_osa_miR684 |
Species | Oryza sativa |
Class | miRNA |
Genome position | Chr11:8801920-8802004 [+] |
Reference genome | IRGSP-1.0 |
Source | SRR1742988;SRR1742992 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 62 - UCUAGCGCUGUCUCUGAUCUCGCC - 85 |
Stem-loop(if miRNA) |
--   C          U  -       GACC    --  A  A  U   CGA AUCAGAGAUA GC CUGGAUC    CUAU  CC GU UC A   ||| |||||||||| || |||||||    ||||  || || ||   GCU UAGUCUCUGU CG GAUCUAG    GAUG  GG CG AG C CC   C          -  C       ---A    CC  C  G  A |
Stem-loop sequence | CGACAUCAGAGAUAUGCCUGGAUCGACCCUAUCCAGUAUCUACAGAGGCCGGCCGUAGAGAUCUAGCGCUGUCUCUGAUCUCGCC |