Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_osa_miR537
Species Oryza sativa
Class miRNA
Genome position Chr4:25387870-25387948 [+]
Reference genome IRGSP-1.0
Source SRR1555746;SRR2097778;SRR2098560;SRR2098822;SRR2890846;SRR1556014
Length 23
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGAACAUCUAAGGGACUGAGUUA - 23
Stem-loop(if miRNA) --   AC      G    U    UAU     A  ---U   C
  AGA  AUCUAA GGAC GAGU   CAUGA GC    UGU A
  |||  |||||| |||| ||||   ||||| ||    ||| A
  UCU  UAGAUU CCUG UUCG   GUAUU UG    ACA A
UU   AA      A    -    --U     A  UUUU   C
Stem-loop sequence AGAACAUCUAAGGGACUGAGUUAUCAUGAAGCUUGUCAAACACAUUUUGUAUUAUGUGCUUGUCCAUUAGAUAAUCUUU