ncRNA ID | novel_osa_miR531 |
Species | Oryza sativa |
Class | miRNA |
Genome position | Chr4:23910465-23910592 [+] |
Reference genome | IRGSP-1.0 |
Source | SRR1555746;SRR1556014 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - UUAGACAGAUCUAUCGGCUUA - 21 |
Stem-loop(if miRNA) |
--    A  --       C      U    UA   G       --U       C   CUGCA    UU   UUAG CA  GAUCUAU GGCUUA CGAG  UUA AUUAUCA   ACAAUCU GUG     UCGG  G   |||| ||  ||||||| |||||| ||||  ||| |||||||   ||||||| |||     ||||   GAUC GU  UUGGAUA CCGAAU GUUC  AAU UAAUAGU   UGUUAGA CAU     AGCC  U GU    -  AC       A      U    UG   A       UGU       U   ---CC    UG |
Stem-loop sequence | UUAGACAGAUCUAUCGGCUUAUCGAGUAUUAGAUUAUCAUACAAUCUCGUGCUGCAUCGGUUGUGUCCGACCUACUAGAUUGUUGUUGAUAAUAUAAGUCUUGUUAAGCCAAUAGGUUCAUGCUAGUG |