ncRNA ID | novel_osa_miR57 |
Species | Oryza sativa |
Class | miRNA |
Genome position | Chr12:1718534-1718635 [-] |
Reference genome | IRGSP-1.0 |
Source | SRR1738242;SRR1849772;SRR3123652 |
Length | 21 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - CAACGUCCAGUACUAGAUUGG - 21 |
Stem-loop(if miRNA) |
--AAC   A    U              A          A    A  CAUA      CUA UACU GAUGUUGACACAUC UAGUAUUACG AUCU GA    U      ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||      GAU AUGA CUGCAACUGUGUAG AUUAUGAUGC UAGA CU    C GGUUA   C    C              G          A    C  AUCG |
Stem-loop sequence | AACCUAAUACUUGAUGUUGACACAUCAUAGUAUUACGAAUCUAGACAUAUCGCUAUCCAGAUACGUAGUAUUAGGAUGUGUCAACGUCCAGUACUAGAUUGG |