Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR616
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold4646:105-287 [-]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source ERR906802
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUAGAAUUCUAGGAUCAAGGGUUU - 24
Stem-loop(if miRNA) -GGUUUAG    A            G UUA      AG        --G  UU   G  U  UG  UU    UUU       AUACGAAAU    U
        GAUU UAGGGUUUUAGA U   GGAUUU  GAUUUUAG   GU  AGC UU UA  AU  AGGG   AGAGAUU         UCGG C
        |||| |||||||||||| |   ||||||  ||||||||   ||  ||| || ||  ||  ||||   |||||||         |||| G
        CUAG AUCUUAAGAUUU G   UUUGGG  UUGGGAUU   CA  UUG GA AU  UG  UUUU   UUUUUAA         AGCC G
UUUGGGAA    G            G UUG      AU        UAA  UU   G  U  GU  UU    UUU       ---------    G
Stem-loop sequence GGUUUAGGAUUAUAGGGUUUUAGAGUUUAGGAUUUAGGAUUUUAGGGUUUAGCGUUUUAUGAUUUAGGGUUUAGAGAUUAUACGAAAUUCGGUCGGGCCGAAAUUUUUUUUUUUUUUGUUGUAUAGGGUUUUACAAUUUAGGGUUUAGGGUUUGUUGGUUUAGAAUUCUAGGAUCAAGGGUUU