ncRNA ID | novel_lus_miR616 |
Species | Linum usitatissimum |
Class | miRNA |
Genome position | scaffold4646:105-287 [-] |
Reference genome | Lusitatissimum_200_BGIv1.0 |
Source | ERR906802 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - UUAGAAUUCUAGGAUCAAGGGUUU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
-GGUUUAG    A            G UUA      AG        --G  UU   G  U  UG  UU    UUU       AUACGAAAU    U         GAUU UAGGGUUUUAGA U   GGAUUU  GAUUUUAG   GU  AGC UU UA  AU  AGGG   AGAGAUU         UCGG C         |||| |||||||||||| |   ||||||  ||||||||   ||  ||| || ||  ||  ||||   |||||||         |||| G         CUAG AUCUUAAGAUUU G   UUUGGG  UUGGGAUU   CA  UUG GA AU  UG  UUUU   UUUUUAA         AGCC G UUUGGGAA    G            G UUG      AU        UAA  UU   G  U  GU  UU    UUU       ---------    G |
Stem-loop sequence | GGUUUAGGAUUAUAGGGUUUUAGAGUUUAGGAUUUAGGAUUUUAGGGUUUAGCGUUUUAUGAUUUAGGGUUUAGAGAUUAUACGAAAUUCGGUCGGGCCGAAAUUUUUUUUUUUUUUGUUGUAUAGGGUUUUACAAUUUAGGGUUUAGGGUUUGUUGGUUUAGAAUUCUAGGAUCAAGGGUUU |