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BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR539
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold35:594473-594620 [-]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source ERR1611439
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - CCCGCCUUGCAUCAACUGAAU - 21
Stem-loop(if miRNA) --   C          U     A      -   UAUCG    CUA   UU C    -      UUCUU    U   CCUU
  UCG UUGGUGCAGG CGGGA CUAAUU GCU     UCCC   GAU  G CGAC GCCAUC     UCUC GGC    C
  ||| |||||||||| ||||| |||||| |||     ||||   |||  | |||| ||||||     |||| |||    U
  AGU AACUACGUUC GCCCU GAUUAA UGA     AGGG   CUG  C GCUG CGGUGG     AGAG UCG    C
UA   C          C     A      G   -----    -CA   -- U    U      --CAU    -   CCCU
Stem-loop sequence UCGCUUGGUGCAGGUCGGGAACUAAUUGCUUAUCGUCCCCUAGAUUUGCCGACGCCAUCUUCUUUCUCUGGCCCUUCUCUCCCGCUGAGAUACGGUGGCUGUCGUCGUCACGGGAAGUGAAUUAGAUCCCGCCUUGCAUCAACUGAAU