Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR389
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold189:359917-360027 [+]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source SRR2996372
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUUAGGGUUUAGGGUUUAGCGGUU - 24
Stem-loop(if miRNA) --      G      G      G      GG    -G   U   G      GA  C
  UUUAGG UUUAGG UUUAGC GUUAGA  UUAG  GUU AGG UUUAGA  UA G
  |||||| |||||| |||||| ||||||  ||||  ||| ||| ||||||  || G
  GGAUUU GGAUUU GGAUUG CGAUUU  GAUU  CGA UUU GGAUUU  AU U
CU      G      G      G      GG    GA   -   G      GG  U
Stem-loop sequence UUUAGGGUUUAGGGUUUAGCGGUUAGAGGUUAGGGUUUAGGGUUUAGAGAUACGGUUUAGGUUUAGGGUUUAGCAGUUAGGGUUUAGCGGUUAGGGUUUAGGGUUUAGGUC