Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR286
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold115:76960-77063 [+]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source SRR2996371;SRR2996372;ERR906803;SRR2996369
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - UGAAGCUGCCAGCAUGAUCUA - 21
Stem-loop(if miRNA) --   A    - -C              UU        UG ---A  GAAAGUA
  UGA GCUG C  AGCAUGAUCUAGCU  GGCUAGUU  C    AC       A
  ||| |||| |  ||||||||||||||  ||||||||  |    ||       A
  ACU CGAC G  UCGUACUGGAUCGA  CCGAUCGA  G    UG       A
UU   C    A UA              UC        GU AUGA  AUAGAGU
Stem-loop sequence UGAAGCUGCCAGCAUGAUCUAGCUUUGGCUAGUUUGCAACGAAAGUAAAAUGAGAUAGUAGUAGUGAGCUAGCCCUAGCUAGGUCAUGCUAUGACAGCCUCAUU