Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR254
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold28:804240-804334 [+]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source SRR2996371;ERR906804;SRR2996369
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 1 - UGAAGCUGCCAGCAUGAUCCUG - 22
Stem-loop(if miRNA) --         C  C    U        CC   AAAG   A GAGAA   GA
  UGAAGCUGC AG AUGA CCUGGUCA  UCA    CCA G     GAU  U
  ||||||||| || |||| ||||||||  |||    ||| |     |||
  ACUUCGACG UC UACU GGACUAGU  AGU    GGU C     UUA  U
UA         U  -    -        --   -CUA   - ---AG   AG
Stem-loop sequence UGAAGCUGCCAGCAUGAUCCUGGUCACCUCAAAAGCCAAGGAGAAGAUGAUUGAAUUGACUGGAUCUGAUGAUCAGGUCAUCUUGCAGCUUCAAU