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BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR209
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold349:950014-950187 [-]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source ERR1611433;SRR2996372;ERR1611434
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 1 - CUUGGACUGAAGGGAGCUCCCU - 22
Stem-loop(if miRNA) --A     UU          CUA     GAUGA     G          -   A  G   AC       UC  AA       -CA   UGU
   GAGCU  CUUCAGUCCA   ACGGG     GAGGU UAAGAUUCAA UUA CU CCG  UCAUUCA  CA  UACUGCA   UUG   A
   |||||  ||||||||||   |||||     ||||| |||||||||| ||| || |||  |||||||  ||  |||||||   |||
   CUCGA  GAAGUCAGGU   UGUCC     UUCCA AUUCUAAGUU AAU GA GGC  AGUAAGU  GU  AUGAUGU   AGU   C
UCC     GG          UCA     -----     -          C   A  G   GA       GA  AG       AAG   UCA
Stem-loop sequence AGAGCUUUCUUCAGUCCACUAACGGGGAUGAGAGGUGUAAGAUUCAAUUAACUGCCGACUCAUUCAUCCAAAUACUGCACAUUGUGUACACUUGAGAAUGUAGUAGAUGAGUGAAUGAAGCGGGAGAUAACUUGAAUCUUAACCUUCCUGUACUUGGACUGAAGGGAGCUCCCU