Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR116
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold266:303381-303490 [-]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source SRR2996370
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 87 - GGAAGUGCAGGACAAGAAGACUCA - 110
Stem-loop(if miRNA) --     U      C   A G   C  -     G      ---AG   A       A
  GGAAG GCAGGA AAG A ACU AG AUUAG UGUAGA     AGA GAAGAGA G
  ||||| |||||| ||| | ||| || ||||| ||||||     ||| |||||||
  CCUUC CGUCUU UUC U UGA UU UAAUC ACAUCU     UCU CUUCUCU A
UA     U      C   C G   A  G     G      CCUAA   C       G
Stem-loop sequence GGAAGUGCAGGACAAGAAGACUCAGAUUAGGUGUAGAAGAGAAGAAGAGAAGAGUCUCUUCCUCUAAUCCUCUACAGCUAAUGUUAAGUGUCCUUCUUCUGCUCUUCCAU