Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_lus_miR55
Species Linum usitatissimum
Class miRNA
Genome position scaffold1035:354036-354127 [-]
Reference genome Lusitatissimum_200_BGIv1.0
Source SRR2996370;ERR1611440
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 71 - CGGCUCUGACACCACUUUGUUA - 92
Stem-loop(if miRNA) --C    C   C       U  UA     UAU  C    G     CU
   GGCU UGA ACCACUU GU  GAGAU   AA UUAU UGUAA  A
   |||| ||| ||||||| ||  |||||   || |||| |||||
   CCGA ACU UGGUGAA CA  UUCUA   UU AAUG ACAUU  G
UUA    C   A       -  UA     -UC  A    A     CC
Stem-loop sequence CGGCUCUGACACCACUUUGUUAGAGAUUAUAACUUAUGUGUAACUAGCCUUACAAGUAAAUUCUAUCUUAUACAAGUGGUAUCACAGCCAUU