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BaseInfo

ncRNA ID novel_jre_miR182
Species Juglans regia
Class miRNA
Genome position NW_017443560.1:107304-107489 [+]
Reference genome wgs.5d
Source SRR1168887;SRR1170964;SRR1170965;SRR1170966
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - ACUUUCUAACUUUUCUUGCUCAAA - 24
Stem-loop(if miRNA) --     C    U  U                 UC  ACC  C   -   U   U   -  CA     -   -   U  U  A  A   G    U   C
  ACUUU UAAC UU CUUGCUCAAAUGAGUAU  CA   AA AUG AGC AGC GCA CA  CAUGG CAA UAU GA GA UC GAU AUGA GAU U
  ||||| |||| || |||||||||||||||||  ||   || ||| ||| ||| ||| ||  ||||| ||| ||| || || || ||| |||| |||
  UGAAA AUUG AA GAACGAGUUUACUCGUA  GU   UU UAC UCG UCG CGU GU  GUACC GUU AUA CU CU AG CUA UACU CUG U
GG     -    U  C                 GA  -CU  A   G   -   U   C  -C     A   U   U  -  -  -   G    -   U
Stem-loop sequence ACUUUCUAACUUUUCUUGCUCAAAUGAGUAUUCCAACCAACAUGAGCUAGCUGCACACACAUGGCAAUAUUGAUGAAUCAGAUGAUGAUGAUCUUUGUCUCAUGAUCGAUCUCUAUAUUUGACCAUGCUGCUGCUGCUGCUGCAUAUUUCUGAGAUGCUCAUUUGAGCAAGCAAUGUUAAAAGUGG