ncRNA ID | novel_jre_miR182 |
Species | Juglans regia |
Class | miRNA |
Genome position | NW_017443560.1:107304-107489 [+] |
Reference genome | wgs.5d |
Source | SRR1168887;SRR1170964;SRR1170965;SRR1170966 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - ACUUUCUAACUUUUCUUGCUCAAA - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
--     C    U  U                 UC  ACC  C   -   U   U   -  CA     -   -   U  U  A  A   G    U   C   ACUUU UAAC UU CUUGCUCAAAUGAGUAU  CA   AA AUG AGC AGC GCA CA  CAUGG CAA UAU GA GA UC GAU AUGA GAU U   ||||| |||| || |||||||||||||||||  ||   || ||| ||| ||| ||| ||  ||||| ||| ||| || || || ||| |||| |||   UGAAA AUUG AA GAACGAGUUUACUCGUA  GU   UU UAC UCG UCG CGU GU  GUACC GUU AUA CU CU AG CUA UACU CUG U GG     -    U  C                 GA  -CU  A   G   -   U   C  -C     A   U   U  -  -  -   G    -   U |
Stem-loop sequence | ACUUUCUAACUUUUCUUGCUCAAAUGAGUAUUCCAACCAACAUGAGCUAGCUGCACACACAUGGCAAUAUUGAUGAAUCAGAUGAUGAUGAUCUUUGUCUCAUGAUCGAUCUCUAUAUUUGACCAUGCUGCUGCUGCUGCUGCAUAUUUCUGAGAUGCUCAUUUGAGCAAGCAAUGUUAAAAGUGG |