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ncRNA ID novel_gra_miR393
Species Gossypium raimondii
Class miRNA
Genome position Chr10:42778492-42778644 [+]
Reference genome Graimondii2_0
Source SRR616257
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 130 - CCACACGGCUUGAGACACGAGCGU - 153
Stem-loop(if miRNA) --  G         -        UU   --   CC   ---       A     GC      ---  GUGACCCAAGUCAGU
  GC UGUGUCUCA GCCGUGUG  ACA  UGG  UAG   CACACGG UUGUG  UUAGCU   GU               G
  || ||||||||| ||||||||  |||  |||  |||   ||||||| |||||  ||||||   ||
  CG GCACAGAGU CGGCACAC  UGU  ACU  AUC   GUGUGCC AGCAC  GAUCGG   CA               A
UG  A         U        -C   AA   UU   CCU       -     AA      GCA  GAUAUGGACACAUUG
Stem-loop sequence GCGUGUGUCUCAGCCGUGUGUUACAUGGCCUAGCACACGGAUUGUGGCUUAGCUGUGUGACCCAAGUCAGUGAGUUACACAGGUAUAGACACGGGCUAGAACACGACCGUGUGUCCCUAUUUCAAAUGUCCACACGGCUUGAGACACGAGCGU