Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gra_miR184
Species Gossypium raimondii
Class miRNA
Genome position Chr6:23720837-23720958 [+]
Reference genome Graimondii2_0
Source SRR616255;SRR616257
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - AUGACAGACUAUGUAUGCAUGACU - 24
Stem-loop(if miRNA) --    CA A       -    U  C        U UG     AG    AG C  A    GAAU
  AUGA  G CUAUGUA UGCA GA UCGUACAC U  AUGCA  UAAA  U UG GUUC    A
  ||||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||  ||||  | || ||||    G
  UACU  C GAUGUAU AUGU UU AGUAUGUG G  UACGU  GUUU  A AC CAAG    A
CU    -A -       G    C  C        - GU     --    GA A  -    GAAU
Stem-loop sequence AUGACAGACUAUGUAUGCAUGACUCGUACACUUUGAUGCAAGUAAAAGUCUGAGUUCGAAUAGAUAAGGAACCAAAAGUUUGUGCAUUGGGUGUAUGACUUCUGUAGUAUGUAGCAUCAUUC