ncRNA ID | gba-miR7506bp |
Species | Gossypium barbadense |
Class | miRNA |
Genome position | NA |
Reference genome | NA |
Source | PNRD |
Length | 22 |
Mature sequence(if miRNA) | NA - AUGUAAGACCAUGUCUGGGACA - NA |
Stem-loop(if miRNA) |
A   A   UAAGA        G        CG  -GG      G   ----AG   UA       --A    UC  GGAC      C    -     A    --A  -CA    --A    C      GGG        -A   GCA  GCC GUG     CCAUGUCU GGACAUGG  UC   UAUUGA ACG      AGC  GUGUAUG   CAUG  UG    AUGCAU GGCU ACAUU UGAG   GG   GUGU   AGAC AUGUCU   ACAUUAUU  UCG   U  ||| |||     |||||||| ||||||||  ||   |||||| |||      |||  |||||||   ||||  ||    |||||| |||| ||||| ||||   ||   ||||   |||| ||||||   ||||||||  |||   U  CGG CAC     GGUACAGG UCUGUACC  AG   GUAACU UGU      UCG  UACGUAC   GUAU  AC    UAUGUG CCGA UGUAG AUUC   CC   UACA   UCUG UACAGA   UGUGAUAG  AGC   G -   C   -----        G        --  AAU      G   AGAGUA   GC       AGG    GU  --AC      A    A     A    CAA  ACG    GGG    -      --A        AG   AGA |
Stem-loop sequence | AGCCAGUGUAAGACCAUGUCUGGGACAUGGCGUCGGUAUUGAGACGAGAGCUAGUGUAUGACAUGUCUGGGACAUGCAUCGGCUACAUUAUGAGAGGCAGUGUAAGACCAUGUCUGGGACAUUAUUAUCGGCAUUGAGACGAGAGAUAGUGUAAGACAUGUCUGGGACAUGCACCAACCUUAAGAUGUAAGCCAGUGUAUCACAUGUAUGGGACAUGCAUCGGCUAUGAGAUGUGUCAAUGUAAGACCAUGUCUGGGACAUGGCACCGGC |