Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gra_miR22
Species Gossypium raimondii
Class miRNA
Genome position Chr1:36881058-36881174 [+]
Reference genome Graimondii2_0
Source SRR616255
Length 22
Mature sequence(if miRNA) 96 - UAGUGAUCUUGAACAGAUUCGG - 117
Stem-loop(if miRNA) --A   UC      UU       UUUUUUUCUUUUC  UU    CC  A   CC    U
   AAU  GUUCAA  UCAUUAA             UU  GUCG  CA AUC  UAAU U
   |||  ||||||  |||||||             ||  ||||  || |||  |||| U
   UUA  CAAGUU  AGUGAUU             AA  UAGU  GU UAG  AUUA C
GGC   GA      CU       --UGUCGUUGCUU  UU    UA  C   AA    U
Stem-loop sequence AAAUUCGUUCAAUUUCAUUAAUUUUUUUCUUUUCUUUUGUCGCCCAAAUCCCUAAUUUUCUAUUAAAGAUCUGAUUGAUUUAAUUCGUUGCUGUUUAGUGAUCUUGAACAGAUUCGG