Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR8525
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr9:34405104-34405227 [+]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1451620
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 104 - UACUAGAUAUCUAACAGCUGG - 124
Stem-loop(if miRNA) --        U       -    GC    A  AA     C UU AUG   --A       UAA  G
  AGUUGUUG AUGUCUA UAAA  CUAU UA  AGGCU G  A   AUG   AGAUGGA   GA A
  |||||||| ||||||| ||||  |||| ||  ||||| |  |   |||   |||||||   ||
  UCGACAAU UAUAGAU AUUU  GAUA AU  UCCGA C  U   UGC   UCUACCU   UU A
GG        C       C    --    A  CC     U UU GUA   AAA       ---  A
Stem-loop sequence AGUUGUUGUAUGUCUAUAAAGCCUAUAUAAAAGGCUCGUUAAUGAUGAAGAUGGAUAAGAGAAAUUUCCAUCUAAACGUAUGUUUCUAGCCUCCUAAAUAGUUUACUAGAUAUCUAACAGCUGG