Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR8100
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr12:3188384-3188553 [-]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1451615
Length 21
Mature sequence(if miRNA) 1 - AGAGGACCACGGAGGCAACUG - 21
Stem-loop(if miRNA) --          A A  A      -      C  A           C   -A     ---A    ----   A A    C   UU     A
  GUUGCCUCCG G UC CUCUCG CCUCCC AG GAUUUUCUUUG UCC  UGCCC    UCUA    CUG C GGUC UCC  GGCAA G
  |||||||||| | || |||||| |||||| || ||||||||||| |||  |||||    ||||    ||| | |||| |||  |||||
  CAACGGAGGC C AG GAGAGC GGAGGG UC CUAGAGGAGAC AGG  ACGGG    AGGU    GGC G CCAG AGG  CCGUU A
GU          A C  -      C      A  C           -   AC     AUAC    AGUA   A C    -   UU     C
Stem-loop sequence GUUGCCUCCGAGAUCACUCUCGCCUCCCCAGAGAUUUUCUUUGCUCCAUGCCCAUCUACUGACAGGUCCUCCUUGGCAAAGACUUGCCUUGGAGACCCGACGGAUGAUGGACAUAGGGCACAGGACAGAGGAGAUCCCUAGGGAGGCCGAGAGGACCACGGAGGCAACUG