ncRNA ID | novel_gma_miR6992 |
Species | Glycine max |
Class | miRNA |
Genome position | Chr10:38526538-38526737 [+] |
Reference genome | Glycine_max_v2.0 |
Source | SRR1451606 |
Length | 24 |
Mature sequence(if miRNA) | 1 - UUGGCGGAUUAUCUUUGUAAUAUU - 24 |
Stem-loop(if miRNA) |
-- UG    A      U    A  UU   ----U   U     UU     U        CAUU    --U    ---   UG       UA   ---U    U     U   U  GCGG UUAUCU UGUA UA  GUU     AUC AUGAA  GAGUU GAACAAGU    ACUA   GUUU   GUU  UUUUUAA  UUA    GUGU GAUAU U   |  |||| |||||| |||| ||  |||     ||| |||||  ||||| ||||||||    ||||   ||||   |||  |||||||  |||    |||| ||||| U   G  UGUC AAUGGA ACAU AU  CAA     UAG UAUUU  UUUAG UUUGUUUA    UGAU   UAAG   UAG  AAGAAUU  AAU    UAUA UUGUA U CU GU    A      U    -  UU   UUAUU   U     -U     U        ----    UUU    UUU   GU       UA   UUUU    -     A |
Stem-loop sequence | UUGGCGGAUUAUCUUUGUAAUAUUGUUUAUCUAUGAAUUGAGUUUGAACAAGUCAUUACUAUGUUUGUUUGUUUUUAAUAUUAUGUGUUGAUAUUUUUAAUGUUAUAUUUUUUAAAUUUAAGAAUGGAUUUUGAAUUUUUAGUAUUUGUUUUGAUUUUUUUAUUGAUUUAUUAACUUUAUACAUAGGUAAACUGUUGGUC |