Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR6992
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr10:38526538-38526737 [+]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1451606
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUGGCGGAUUAUCUUUGUAAUAUU - 24
Stem-loop(if miRNA) -- UG    A      U    A  UU   ----U   U     UU     U        CAUU    --U    ---   UG       UA   ---U    U     U
  U  GCGG UUAUCU UGUA UA  GUU     AUC AUGAA  GAGUU GAACAAGU    ACUA   GUUU   GUU  UUUUUAA  UUA    GUGU GAUAU U
  |  |||| |||||| |||| ||  |||     ||| |||||  ||||| ||||||||    ||||   ||||   |||  |||||||  |||    |||| ||||| U
  G  UGUC AAUGGA ACAU AU  CAA     UAG UAUUU  UUUAG UUUGUUUA    UGAU   UAAG   UAG  AAGAAUU  AAU    UAUA UUGUA U
CU GU    A      U    -  UU   UUAUU   U     -U     U        ----    UUU    UUU   GU       UA   UUUU    -     A
Stem-loop sequence UUGGCGGAUUAUCUUUGUAAUAUUGUUUAUCUAUGAAUUGAGUUUGAACAAGUCAUUACUAUGUUUGUUUGUUUUUAAUAUUAUGUGUUGAUAUUUUUAAUGUUAUAUUUUUUAAAUUUAAGAAUGGAUUUUGAAUUUUUAGUAUUUGUUUUGAUUUUUUUAUUGAUUUAUUAACUUUAUACAUAGGUAAACUGUUGGUC