Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR5518
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr7:35170399-35170546 [+]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR835761
Length 25
Mature sequence(if miRNA) 1 - GAUUGAUCAAACAACUGCAGAAGCG - 25
Stem-loop(if miRNA) --   U A    A          ---  C   A   ACUA       UGUA  U  UU  U   -      A    -    U
  GAU G UCAA CAACUGCAGA   AG GGA CAA    AAAAGUC    GA UG  GU GUA ACAUGU UGCA CGAU G
  ||| | |||| ||||||||||   || ||| |||    |||||||    || ||  || ||| |||||| |||| ||||
  CUA C GGUU GUUGAUGUCU   UC CCU GUU    UUUUUAG    CU AU  CA CGU UGUACA AUGU GUUG U
GA   - -    A          CUU  U   -   ---G       --UC  U  -U  -   A      -    U    U
Stem-loop sequence GAUUGAUCAAACAACUGCAGAAGCGGAACAAACUAAAAAGUCUGUAGAUUGUUGUUGUAACAUGUAUGCACGAUUGUUGUUGUUGUAACAUGUAUGCACUUAUUCCUGAUUUUUGUUGUCCUCUUUCUCUGUAGUUGAUUGGCAUCAG