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BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR5059
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr15:9801647-9801811 [+]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR2968978
Length 24
Mature sequence(if miRNA) 1 - UUGAUGCACAACGGAAUCACGACU - 24
Stem-loop(if miRNA) --      C    CG      C  CUCUA     CAACA       --A    AAA       CG   CCA    AAU       UA
  UUGAUG ACAA  GAAUCA GA     UUGUG     GGUUUUG   UGCA   GGAAUCA  AUU   UUGU   UGUGCAG  A
  |||||| ||||  |||||| ||     |||||     |||||||   ||||   |||||||  |||   ||||   |||||||  G
  AAUUAC UGUU  UUUAGU CU     AAUAC     UCAAAAC   AUGU   CCUUAGU  UAA   AACA   ACACGUU  U
AC      A    AU      A  AAAAC     -AUUA       AAC    -CG       AU   ---    ---       GU
Stem-loop sequence UUGAUGCACAACGGAAUCACGACUCUAUUGUGCAACAGGUUUUGAUGCAAAAGGAAUCACGAUUCCAUUGUAAUUGUGCAGUAAGUUGUUGCACAACAAAAUUAUGAUUCCGCUGUACAACAAAACUAUUACAUAACAAAAUCAUGAUUUUAUUGUACAUUAACA