Search result

BaseInfo

ncRNA ID novel_gma_miR3864
Species Glycine max
Class miRNA
Genome position Chr2:42992714-42992850 [-]
Reference genome Glycine_max_v2.0
Source SRR1451676
Length 20
Mature sequence(if miRNA) 118 - AUGUAAUUAUUGAUUCUCUG - 137
Stem-loop(if miRNA) --  G  A        U       G     CUAUAU  A     U    A     UAU    U  UU   U
  AU UA UUAUUGAU CUCUGAU ACAAA      AU UUAAG UGGA AAUGG   UGUU GA  UGU U
  || || |||||||| ||||||| |||||      || ||||| |||| |||||   |||| ||  ||| C
  UA GU GGUAAUUA GGGACUA UGUUU      UA GAUUU AUCU UUGCU   ACAA CU  ACG U
GA  G  A        U       G     ------  A     C    A     CUU    C  CU   U
Stem-loop sequence AUGUAAUUAUUGAUUCUCUGAUGACAAACUAUAUAUAUUAAGUUGGAAAAUGGUAUUGUUUGAUUUGUUUCUUGCAUCUCCAACAUUCUCGUUAUCUACUUUAGAAUUUUGUGAUCAGGGUAUUAAUGGAUGGAUAG